商業模式要想由設計藍圖轉化為業績結果，必須得到組織的有效執行，即必須實現創新商業模式與組織執行體系三個層面的協同與互動——戰略結構層面、組織系統層面、員工行為層面，要實現商業模式的有效創新，這三個層面的管理系統，也需要圍繞新的商業模式進行變革、優化。只有實現組織系統與創新商業模式、以及系統彼此之間的協同一致、有效互動，創新的商業模式才能夠得到真正的執行、實現。因此，與這三個層面執行能力有關的組織系統要素，都必須納入商業模式轉變的關注范疇。

如果僅僅停留在根據外部市場機會進行的客戶選擇、客戶價值主張確定的層面，或者只考慮商業模式的戰略層面設計，忽略了落實組織系統層面、員工行為層面的相應創新與協同，或者在商業模式創新與改變的過程中，忽略了組織系統變革和員工行為系統的變革，商業模式的轉變顯然是無法實現的。

“三分戰略七分執行”，事實上，在發生問題的企業中，組織層面和員工層面的改進水平、協同互動狀況，往往是商業模式創新過程中不被關注的盲點，因此，也往往成為決定商業模式能否完善、能否有效執行、能否在競爭中達到預期目的的關鍵要素。